洪武五年（）的一天，对于亚圣孟子的神灵来说，并不是安静的日子。这一天盛怒的朱元璋想把孟子的牌位从孔庙四配的位置上撤下来，取消他配享的待遇。这一件事的发生不仅对孟子本身，而且对儒家的传统信仰将产生极为强烈的冲击，这一事件的原因是什么呢？
明太祖朱元璋我们首先要从对儒生首鼠两端的朱元璋身上找原因。在朱元璋一生的政治生涯中，重用佛、道又时而杀戮和尚和道士；对儒家、法家也是如此，虽然他经常大骂李斯、韩非等法家，但他治国思想的精髓又多是从法家著作中学来的；他一向标榜孔孟，言必称三代，儒家思想似乎是他唯一的旗帜，但在他骨子里又实在看不起儒生。
诚意伯刘基明朝建立之初，不仅治理地方需要大量人才，而且南京中央政府也需要一批文人学士。朱元璋对网罗天下的贤才，包括元遗民，还是表现出相当的耐心与真诚。对于一些早期投奔他的读书人，如宋濂、刘基、陶安等，他也一度非常信任。建国前后对他们也曾给予特殊优待。如把刘基看成自己的诸葛亮、张良，从不直呼其姓名，并尊称为先生。这算是皇帝能给予的最高礼遇了。
开国第一文臣宋濂明初四先生之一的宋濂更是一个标准的儒生，他曾做过朱元璋长子朱标的老师。为朱元璋讲解经史和治国平天下之道，被称为明代开国文臣之首。是朱元璋的文学、儒学首席顾问。相当长的时间之内，君臣关系相当融洽。很早就跟着朱元璋的陶安也同样受到礼遇。朱元璋还亲自为陶安的府邸撰写：
国朝谋略无双士，翰苑文章第一家。
的楹联使其门楣生辉，文士与荣。
但其他读书人就没有这么幸运，尤其是从元朝廷转投过来的那些读书人。最为朱元璋所鄙视的代表人物，要推号称元朝国史的危素。危素在元朝曾参与编撰“宋、辽、金”三史，撰写“后妃”等传。
在《玉堂丛语》中说：危学士素以胜国名卿，事我太祖，年既高矣，上重其文学，礼待之。一日。上燕坐屏后，素不知也。步履屏外，甚为舒徐。上隔屏问为谁？素对曰：“老臣危素”。语复雍缓。上低声笑曰：“我只道是伯夷、叔齐来”。
如此学富五车之人，尚且受到如此轻慢，其他的人就不用说了，动辄惨遭杀身之祸。
孔子画像朱元璋对历朝历代所给予的各路神仙、名人的各种封号也不甚感兴趣。据史料记载，洪武元年三月，大将军徐达攻克山东济宁，至圣先师孔老夫子的故乡曲阜正属济宁路。朱元璋便传令孔子的第55代孙孔元，国子监祭酒，孔克坚到南京朝见。孔克坚犹豫不决，称病不出，只派他的儿子孔希学前往。朱元璋疑心这位袭封衍圣公看不起他这个出身微贱的皇帝，感受到了莫大的侮辱，虽再三压抑，终是恼怒难消。便下一道诏书快马送给孔克坚说：
“吾虽起庶民，然古人由民而称帝者，汉之高祖也。尔言有疾，未知实否。若称疾以慢吾，不可以”。
孔克坚这才感觉大事不妙。便日夜兼程，赶到南京。孔克坚的到来使朱元璋转怒为喜。洪武元年四月初八，朱元璋在谨身殿，态度亲切而温和地召见了孔克坚。八月壬申，诏“衍圣公袭封及授曲阜知县，并如前代制”。从此明清相沿，对袭封衍圣公便只“养之以禄而不任之以事”。
孔子画像但极度自尊、刚愎自用的朱元璋，对于“至圣文宣王”孔子这么一个高高在上的灵魂的存在，是一百个不情愿。洪武二年（）他就曾下诏说：“孔庙春秋释奠，止行于曲阜，天下不必通祀”。诏令一下，朝野大哗，大臣们纷纷上书反对。经过大臣们这么一闹，朱元璋也觉得实在说不下去。只得极不情愿地收回了命令。但他一直又于心不甘。于是几年之后便把这一腔无名之火发在了孟子老先生的头上。
孟子牌位其次，从孟子的思想中找原因。在中国古代思想中，“民本”思想在孟子那里表现得最为突出。他有一句名言：
“民为贵，社稷次之，君为轻”。
孟子认为土地、人民、政事是国家的三宝，谁能保护人民那他就一定能称王。如果残害百姓，就是孤家寡人的“一夫”，这种人是不配得天下的，即使得到天下也应该被打倒，推翻这样的天子不是犯上作乱的弑君行为。正如周武王“诛一夫纣”推翻殷纣王的统治一样，是为民除害。孟子，还说：“得到天下的人，如果失去了人民，那就一定会失去天下，反之没有天下的人，只要得到人民的拥护就一定能得到天下”。就是说，人民比天子更重要。
曲阜孔庙天子若不能保民，天下之人就可以得而共诛之。所以孟子并不主张天下百姓效忠于一姓一人。在孟子的心中根本就不存在绝对的天子权威，君臣关系也是相对的。他说：“若天子不仁，则不保四海”。这里孟子所说的“仁”，主要是对民来说的，为了得到天下保有四海，天子就必须实行“仁政”爱护人民。
那么怎样才能得民呢？孟子认为要为民所想，不要把人民厌恶的东西强加给他们。孟子认为“以德服人”的政治称为“仁政王道”，与此相反“以力服人”而丧失民心，孟子称之为“霸道”“暴君”。比较这两种政治，孟子进一步认为
“以力服人者非心服也，力不瞻也；以德服人者。中心悦而诚服也”。
天子若“以德服人”，就是“仁者”，而“仁者”则是无敌的，“仁者”为什么会无敌于天下呢？孟子说：
“因为得道者多助，天时不如地利，地利不如人和，得人和当然也就所向无敌了。以力服人的暴君，企图用武力征服别人，就不断发动战争，这样就犯了大罪，应该“服上刑”。
孔子牌位和四配生活于战国战乱不休，杀人如麻这种乱世之中的孟子，能有这种超越时代的思想是难能可贵的。但这些思想火花对于通过强权建立朱家千秋大业的朱元璋来说尤其刺眼，再加上朱元璋本来就对孟子那个时代的异说纷呈的各种学说很反感。
罢全国普遍祭祀孔子的问题最终没能执行。朱元璋本来就一直耿耿于怀，洪武五年的一天，朱元璋不经意又看到了孟子那
“民贵、君轻”，“君视臣如手足，则臣视君如心腹；君之视臣如犬马，则臣视君如国人；君之视臣如土芥，则臣视君如寇仇”。以及“霸道、暴君、一夫”之类的话，
更觉得如芒刺在背，一边读一边骂：
“如此荒谬之言，哪里像臣子说的话？倘此老在今日，岂可免我一刀”。
亚圣孟子当天就命令将孟子逐出文庙殿外，不得配享。并发狠的说：“诸大臣有谏者以不敬论，且命金吾射之”。看到这个圣旨，满朝文武惊恐不知所措。
这时，刑部尚书钱唐挺身而出，抗疏直言，为孟子鸣冤。朱元璋当然是异常愤怒，内侍把皇上动怒的情景描述给钱唐，钱唐说：“臣为孟轲而死，死有余荣”。说罢，让人抬着事先准备好的棺材，袒着胸抱着必死的决心，直向奉天殿方向走去。朝堂的大臣都为钱唐捏了一把汗。内侍们也飞跑进去禀报。只见，朱元璋果然命金吾卫士杀气腾腾的拉满弓，正等着钱唐的到来。见到钱唐视死如归的模样，气头上的朱元璋更加愤怒，便真的让金吾卫士连射了好几箭。钱唐的左臂、左肩、胸部都中了箭。被射倒在朝堂上，但仍然挣扎着向皇帝的座位前爬去，看着钱唐痛苦而坚毅的样子，朱元璋终于退缩了。
此事之后，朱元璋不仅没有因此治钱唐的罪，医院的太医仔细地为他治疗箭伤。第二年冷静下来的朱元璋就下了一道谕旨说：“孟子辨异端，辟邪说，发明孔子之道，配享如故”。算是极不情愿的把孟子的牌位又请了回去。如此说来钱唐对亚圣孟子，可谓居功至伟，难怪后人对其赞不绝口。
但朱元璋觉得这个孟老头实在有点讨厌，
什么“民为贵，社稷次之，君为轻”；什么“草芥、寇仇”，什么“杀人之父，人亦杀其父，杀人之兄，人亦杀其兄”，什么“残贼之人，谓之一夫，闻诛一夫纣，未闻弑君也”；什么“君有大过则谏，反复之而不听，则易位”。
四书之孟子这些真的有点像指着鼻子在数落自己。特别是《孟子》，又是官定的四书之一，各级学校用来做教本，科举考试又来命题，这岂不把天下的学子们都教坏了。洪武二十七年，朱元璋最终还是没有放过孟子。既然配享不能动，我动你的书应该可以吧。于是命令翰林院学士刘三吾对《孟子》进行删节，82岁的翰林学士刘三吾奉命后战战兢兢经过反复揣摩。共删掉85条朱元璋感到刺眼的内容，保留了余条成《孟子节文》一书。朱元璋立即下了一道诏令，规定“今自八十五条之内，课士不以命题，科举不以取士，一以圣贤中正之学（指《孟子节文》一书）。孟子配享的这段公案，至此才算结束。
孟子的思想在那个时代是超前的，他认为君臣，君民之间的关系都是相互的，这和朱元璋一姓家天下，皇权高度集中的思想相违背，这才是朱元璋想把孟子请出孔庙的原因。