清顺治十八年（年），明朝将领郑成功率兵驱逐荷兰殖民者，占领台湾，将台南赤崁地区改为“东都明京”，并设立一府二县，府名为“承天府”（即今赤崁城）。郑成功死后，其子郑经继位，把东都明京改为“东宁”。康熙二十二年(年)，清将施琅攻陷澎湖列岛直逼台湾，郑成功之孙、郑经次子郑克塽上表请降，清政府自此将台湾纳入版图，在台南设台湾府，为全台首府，下设诸罗、台湾、凤山3县，与厦门合设道官1员，拨兵1万名防守，台湾成为福建省的1个府。至光绪十一年(年)九月，始分立为台湾省。台南市历来为台湾南部教育之中心，现在拥有大专院校十余所。国立成功大学、国立交通大学两所知名大学均于台南设有校区。其他公立教育机构计有国民小学所，中学58所，高级中学及职业学校36所，而台南一中、台南女中、台南二中、家齐女中四所明星高中则俗称为“台南四省中”。因此，作为在台湾教育发展史占有重要的地位的台南，有座崇仰先圣的古迹任谁都得去看，那便是有“全台首学”之称的台南孔庙。
台南孔庙又称文庙，位于台南市南门路，始建于明永历年间，是全台最早的文庙，也是郑成功收复台湾后在台湾建立的第一所高等学府，台南孔庙的建立标志着儒学正式进入台湾，成为台湾教育发展史上的一个重要里程碑。
台南孔庙目前列为台湾一级古迹，它是由郑成功部将，时任监军御史陈永华倡议修建，历经数次修葺，庙门有一“全台首学”金字横匾作为登堂之阶，红墙琉璃，古木扶疏，宁静清婉，庄严肃穆。
黄昏雨后，走进孔庙内，古朴的庙堂建筑危檐峭耸，古树虬盘，一块斑驳的石碑静静诉说着先贤们拓荒宝岛、散播中华文明的丰功伟绩。
孔庙修建落成后，内设“太学”，陈永华被嗣王郑经任命为“学院”，也就是太学的主持。由此在台湾岛上，开始建起了较为完整的教育体系，掀开了台湾教育史的崭新的一页，中华传统文化及教育由此在台湾岛上传播开来。
当时明郑规定：“凡民八岁入学，课以经史文章”。所学内容，以讲授三字经、千字文和儒家经典为主，随后台湾也开始实行科举制度：每三年州试一次，州试入选者又经府试、院试，取进者入太学；最后每三年一次大试，成绩佳者即可入朝为官。
围墙东西辟有礼门、义路，意为遵礼崇义的夫子之路，即修德进业之道，而今围墙倾颓，现仅剩两道门扇伫立前庭，游客当恭敬由此路此门而入以示知书达礼。
草坪旁有民国五十四年，台南市纪念孔庙落成周年大典的纪念碑。
每年农历九月二十八日是“至圣先师孔子诞辰”，也是台湾的“教师节”，台南市政府都要按照古制在这里举行盛大的祭孔典礼，届时万人朝拜，人潮涌流，庄严隆重，十分热闹。
如今的孔庙，为了表示对孔子的尊敬和对文化的尊重，园内还增设了一些现代艺术陶塑，古今结合，意趣甚浓。
孔庙坐北朝南，恢宏庄严，屋顶为传统的歇山重檐式，屋脊两端翘起，十分优美，属典型的南中国式建筑。与其他孔庙不同的是台南孔庙大成殿既无旁柱，也无回廊，以伸出厚墙的挑梁支撑。东西两庑交于崇圣祠，旁庑则陪祀孔子的72个弟子和历代先儒先贤的牌位。两侧毗连礼器库、乐器库，古代形制礼乐器皆妥为保存，以供祭孔之用。
大成殿是全庙的中心。郑成功父子时代这里为国子监，是当时的最高学府，专办科举考试。大成殿的中央供奉着“至圣先师孔子”的灵牌。在灵牌上面的殿梁上，悬挂着许多清代皇帝所钦赐御匾，其中有康熙的“万世师表”、乾隆的“与天地参”、咸丰的“德齐帱载”、光绪的“斯文在兹”等。
大成殿前有露台，露台前有棂星门，平时紧闭，惟有祭孔大典时才开。棂星门东西两旁有“名宦祠”、“乡贤祠”、“孝子祠”、“节孝祠”。其中古朴典雅的“明伦堂”，是儒家讲习伦常之理的地方，学生在此由学官教谕、训导，相当于府学的教室。
在明伦堂的正面墙壁上，有宋元大书法家赵孟手书的八块《大学》全书遗迹，极为珍贵，如今仅存4块。在明伦堂之后是文昌阁，楼高3层，呈塔形布局，是孔庙的最高建筑。奉祀文昌帝君，并作为藏书之所。
明伦堂可以参观旧时学生们研习儒学经典的场景，三百多年来，这里始终保持原样，未曾经历大型修缮。
室内高悬的“忠孝节义”中华传统四字美德，这四个字的内涵非常丰富，能够在大环境中去宣导这样一种道德准则，是非常有益、实在的。在台湾的日子里，充分感受到不少传统美德仍贯穿于大多数台湾同胞的日常言行中。
台南孔庙是全台湾历史最为悠久，保持较为完整的一座孔庙。从清朝历代皇帝到台湾历届主政，都会给台南孔庙颁发题写牌匾，足见此地的文化教育地位有多高。走在这三百多年前的文化遗迹中，不由得你不小心翼翼地去体会它的每一个角落和每一处记忆。曼妙无比的林荫小路，悠远时空传来的阳光就这样被婆娑枝叶和飞檐格棂筛成斑驳透过来，仰望先贤，就像是迎接那一束束古老智慧的光芒！