明太祖对孔府非常重视，有一通立于曲阜衍圣公府二门之内的“对话碑”记录了他与孔子后人孔克坚的一段有趣的对话。全文如下：
洪武元年十一月十四日臣孔克坚谨身殿内对百官面奉圣旨。“老秀才近前来，你多少年纪也？”对曰：“臣五十三岁也。”上曰：“我看你是有福快活的人，不委付你勾当。你常常写书给你的孩儿。我看你资质也温厚，是成家的人。你祖宗留下三纲五常，垂宪万世的好法度。你家里不读书，是不守你祖宗法度，如何中？你老也常写书教训者，休怠惰了。于我朝代里，你家里再出一个好人啊不好？”二十日于谨身殿西头廊房下奏上位，曲阜进表的，回去。臣将主上十四日戒谕的圣旨，备细写将去了。上喜曰：“道与他，少吃酒，多读书者。”前衍圣公国子祭酒克坚记。
这段对话，丝毫没有碑文的庄严，竟有几分元杂剧戏文般的生动，但并不让人怀疑记录的真实性。五年之后，孔克坚驾鹤西归，他的儿子孔希学作为大明资善大夫袭封衍圣公之位，再一次面奉圣谕时，朱元璋的教诲和面对孔克坚时大同小异，记录的碑文全变了味道。对孔希学的叮嘱真的成了皇帝惯用的“圣谕”：“尔若不读书，孤朕意矣”“尔年近四十，志虑渐坚定，见识渐老成，正好读圣人之书，亲近名师良友，早夜讲明道义，以期有成。学成之后，四方之人知尔之能，俱来执经问难。且曰此无长孔氏子孙弱者，岂不美欤！不美欤！”。（引自王愚的新浪博客《朱元璋有一段有趣的对话》）
鲁王朱檀封在兖州，足见父亲对他寄予厚望，希望他能在这贤哲辈出的圣人之地做出一番成就。太祖派朝廷重臣到曲阜祭孔，颁《明太祖遣祭阙里孔庙文》曰：
惟神昔生周天王之国，实居鲁城圣德天成，继述前王治世之法。虽当时列国鼎峙，其道未行，垂教于后，以至于今凡有国家，大有德焉。自汉之下，以神通祀海内，朕代前往统率庶民，目书检点，忽睹神之训言，非其鬼而祭之，谄也。敬鬼神而远之，祭之以礼，此非圣贤明言，他何能道？故不敢通祀，暴殄天物，以累神之圣德，兹以香币牲斋茶盛式陈明蔫，惟神鉴焉。
可见这位布衣出身的草莽皇帝继承了历代帝王登基后尊孔、祭孔的惯例，对至圣先师孔子满怀敬畏之心。（引自《兖州明代鲁王府》杜新广等“兖州明代鲁王府的沿革与兴替”一文）