同文门是奎文阁前的重要屏障，也是孔庙第五道大门。始建于北宋初期，系当时孔庙大门。5间，两侧有回廊，金代成为二门，明代孔庙南扩，门逐渐退居次要地位。清初名“参同门”，取孔子之德与天地参同之意。雍正八年（公元年）清世宗钦命为“同文门”，取“书同文，行同伦”之意。乾隆十三年高宗题写门匾。
“同文”二字出自《礼记》，“书同文，行同伦”，意为统一语言、统一文化、统一思想，使整个人类思想都统一到儒学上来。
今门独立院中，周无墙垣，高16.96米，长米，宽9.34米，中间辟3门，单檐黄瓦歇山顶，七檩三柱分式木架。
在同文门周围有四幢明代御碑。每幢高6米多，宽2米多，碑下的龟趺高1米多。碑额精雕盘龙，绕日盘旋栩栩如生。碑文内容多是尊崇孔子。
东北为洪武碑，西北为永乐碑，洪武碑和永乐碑在明弘治十二年（年）被火烧毁，弘治十六年（年）由皇帝钦命重立。洪武、永乐、弘治三碑通高二丈四尺二寸（7.60米）,由弘治年间的书法家乔宗书，著名刻工阎杰刻石。
东南为“重修孔子庙碑”，高7.85米，宽2.27米，厚近半米，立于明成化四年（年），所以习称“成化碑”。是孔庙中体积最大的一幢碑。
成化碑，为明宪宗朱见深所立。碑文极力推崇孔子思想，“朕惟孔子之道，有天下者一日不可暂缺”。字楷书，书体端庄，结构严谨，为世人所称道，是明代明碑之一。以精湛的书法著称于世。
成化碑有两个情况引起历代大家名人的注意。一是成化碑正楷字写的好、规范化、标准化，精湛引人，字体笔法有“著称于世”的评语；二是对孔子评价最高，历代皇帝对孔子都有评说，评价最高的是成化皇帝，他把孔子的思想、办法比作吃饭、穿衣、花钱，一天也离不开，有了孔子的道理和办法，就能人尽其才，物尽其用，地尽其力，不然就乱套啦。说有孔子之道则有天下，没孔子之道则无天下，反孔子之道则失天下。如碑文称：“朕唯孔子之道，天下一日不可无焉，有孔子之道则纲常正而伦理明，万物各得其所矣...，孔子之道之在天下如布帛粟菽，民生日用不可暂缺，...天生孔子纵之为圣，生之安行仁义中正，师道兴起，从游三千，往圣是继。”
西南为弘治碑。弘治碑右侧有明代才子湖南长沙李东阳绘制的“孔庙图”价值很高。